近日，广东省科学院生态环境与土壤研究所孙蔚旻研究员团队，自主开发了分子生物学新方法（稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用技术），并利用该方法在好氧锑氧化基础研究方面取得了新进展。相关研究成果《Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics》发表在国际环境领域权威期刊《FEMS Microbiology Ecology》。
该方法采用室内微宇宙培养实验，通过对稳定同位素示踪（stable isotope probing，SIP）-宏基因组分箱联用技术进行优化，将SIP直接与宏基因组测序技术相结合，省略了16S rRNA高通量测序步骤；同时，以13C-NaHCO3为唯一碳源，锚定了土壤中驱动好氧锑氧化过程的自养型功能微生物，揭示了这些功能微生物的代谢途径，解析了非淹水期锑污染水稻土壤中的好氧锑氧化过程。
孙蔚旻自组建团队以来，成功开发并应用分子生物学新方法（稳定同位素示踪-宏基因组分箱联用平台），积极开展相关功能微生物类群鉴定和代谢途径等方面的研究工作，不断通过技术方法的创新，进一步优化完善该技术平台的应用能力。
SIP-宏基因组测序分析直接联用技术路线图
论文信息：
Miaomiao Zhang, Max Kolton, Zhe Li, Hanzhi Lin, Fangbai Li, Guimei Lu, Pin Gao, Xiaoxu Sun, Rui Xu, Fuqing Xu, Weimin Sun，2021. Bacteria responsible for antimonite oxidation in antimony-contaminated soil revealed by DNA-SIP coupled to metagenomics. https://doi.org/10.1021/acs.est.0c01601
（省科学院土壤环境所土壤生态修复团队 张苗苗/供稿）
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